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Science:新方法鉴定肠道微生物组产生的代谢物分子

日期:2019-12-20 22:32:00 来源: 生物谷 点击:

肠道菌群产生数百种以高水平存在于血液循环中的分子,它们的水平在不同人之间差异很大。这些分子是研究肠道微生物组与宿主相互作用的一个有前景的起点;少数经过详细描述的分子具有强效的免疫或代谢调节活性,并且是G蛋白偶联受体或核激素受体的配体。但是,在大多数情况下,这些分子的产生尚未与特定的细菌菌株或代谢途径相关联在一起,并且难以弄清每种分子对宿主生物学的贡献。
一种敲除宿主组织中肠道微生物组衍生性分子(编者注:由肠道微生物组产生的分子)的通用方法将能够探究它们调节宿主生物学和疾病过程的机制。由于受到肠道微生物组中细菌物种的遗传可操作性的限制,开发这样的方法一直是难以实现的。梭菌(Clostridium)及其近亲厌氧的厚壁菌(Firmicute)尤其难以操纵。由于厌氧的厚壁菌是这个分子库(编者注:指的是由肠道微生物组产生的全部分子)中许多分子的来源,因此它们的遗传难处理性是研究肠道微生物组衍生性分子的主要挑战。
在一项新的研究中,来自美国斯坦福大学等研究机构的研究人员描述了一种基于CRISPR-Cas9的方法,用于在模式共生梭菌---生孢梭菌(Clostridium sporogenes)---中可靠地构建无需进行标记的不产生特定代谢物分子的细菌突变体